组学及其在鱼类早期胚胎发育中的应用Multi-Omics and its application in early developing fish embryos

报告题目：组学及其在鱼类早期胚胎发育中的应用Multi-Omics and its application in early developing fish embryos

报告人：洪旎  副研究员

报告时间：2024年6月25日（周二），下午13:00

报告地点：水产与生命学院A419

主持人：王浩

报告人简介：

洪旎，南方科技大学副研究员。2006年毕业于获德国维尔茨堡大学（University of Wuerzburg），2012年获新加坡国立大学博士学位，2015年在美国国立卫生研究院（NIH）完成博士后。现为南方科技大学生命科学学院副研究员，入选深圳市海外人才计划（孔雀计划）。长期发展和优化组学技术解析斑马鱼早期胚胎发育机制。重要成果包括建立了首例单倍体青鳉鱼胚胎干细胞，发现斑马鱼胚胎细胞第一次产生差异的时间节点及其分子调控机制。在Science等杂志发表论文近50篇，其中作为通讯作者在Nature Cancer、PNAS、Nucleic Acids Res、Cell Discovery等期刊发表多篇论文。

报告摘要：

具有全能性的受精卵经过一系列分裂、分化，形成不同的细胞类型，最终发育成为一个完整的生命个体。在胚胎发育这种动态的生物过程中，细胞与细胞之间逐渐形成异质性，这种异质性决定细胞最终的命运。因此，单细胞水平探索细胞命运决定的分子机制，是研究任何动态过程的必要手段。基于优化的单细胞染色质可及性测序，分析了10000多个细胞核的染色质可及性发现斑马鱼胚胎细胞在染色质层面第一次出现离散的细胞簇是在受精后4.1小时左右，即胚胎从sphere到dome的过渡期。随后细致刻画了斑马鱼胚胎在第一次细胞命运决定时各细胞类型的染色质状态，找到了很多细胞特异性的增强子和核心转录因子，并且填补了这一时期单细胞染色质数据的缺乏，为后续的研究提供了组学数据基础。

欢迎各位老师和同学参加！

                                                    （水产与生命学院）