胡鹏

胡鹏，博士

上海海洋大学水产与生命学院教授、博士生导师

水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室主任

上海海洋大学青年教师工作委员会主任

国家高层次人才计划入选者

邮箱：phu@shou.edu.cn 

学术网页: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=c9x6MQcAAAAJ

ORICD： 0000-0002-0017-1948

实验室网页：http://www.hulabshou.cn/

项目支持

国家自然科学基金委员会

国家级高层次人才计划

上海海洋大学高层次人才启动经费

研究方向

单细胞基因组学新技术开发与应用

鱼类抗逆遗传育种

极地鱼类温度适应性进化

教育和学习经历

美国宾夕法尼亚大学，美国宾州费城市

•2016年4月- 2021年12月  博士后, 医学院

•合作导师：Hao Wu教授

上海海洋大学，中国上海市

•2014年2月- 2016年4月  博士后, 生命学院

•合作导师：陈良标 教授

中国科学院遗传与发育生物学研究所，中国北京市

•2009年9月- 2014年1月  理学博士，生物信息学

•导师：陈良标 教授

中国农业大学，中国北京市

•2007年9月- 2009年7月  农学硕士，动物遗传育种与繁殖

•导师：王爱国 教授

华中农业大学，中国湖北省武汉市

•2003年9月- 2007年7月  农学学士，动物科学

学术兼职

国际干细胞协会会员

Frontiers in Genetics, 客座副主编, 2020/10起

  Molecular Biology & Evolution, Fish and Shellfish Immunology, JWAS等期刊审稿人

获奖情况

鱼类抗冻蛋白基因的起源和低温适应的分子发育机制研究，2021年教育部高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）一等奖

发表文章及预印本

[1]Hu P*, Fabyanic E*, Kwon DY, Tang S, Zhou Z, Wu H (2017) Dissecting Cell-Type Composition and Activity-Dependent Transcriptional State in Mammalian Brains by Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq. Molecular Cell 68: 1006-1015.e1007.第一批研发了单细胞核转录组测序技术，首次鉴定了戊四氮诱导痫癫痫小鼠模型中细胞类型特异的转录图谱。

[2]Hu P*, Liu J*, Zhao J*, Wilkins BJ, Lupino K, Wu H, Pei L (2018) Single-nucleus transcriptomic survey of cell diversity and functional maturation in postnatal mammalian hearts. Genes & Development 32: 1344-1357. 应用研发的单细胞核转录组测序技术，次首次描绘了出生后小鼠心脏发育的单细胞图谱。

[3]Qiu Q*, Hu P*(共同第一), Qiu X, Govek KW, Camara PG, Wu H (2020) Massively parallel and time-resolved single-cell RNA sequencing with scNT-Seq. Nature Methods, 17(10): 991-1001. 开发了型新型的高通量单细胞新生转录本标记技术，准确定量单个细胞中“新”和“旧”的转录本，能准确用于追溯单细胞的轨迹。

[4]Hu P, Liu M, Zhang D, Wang J, Niu H, Liu Y, Wu Z, Han B, Zhai W, Shen Y, Chen L (2015) Global identification of the genetic networks and cis-regulatory elements of the cold response in zebrafish. Nucleic Acids Research 43: 9198-9213.系统性地鉴定了基因组中低温响应的式用件顺式作用元件，绘制了模式动物斑马鱼低温响应的调控网络。

[5]Ho Y*, Hu P*(共同第一), Peel MT, Chen S, Camara PG, Epstein DJ, Wu H, Liebhaber SA (2020) Single cell transcriptomic analysis of the adult mouse pituitary reveals a novel multi-hormone cell cluster and physiologic demand-induced lineage plasticity. Protein & Cell: 1-19.通过单细胞转录组学分析技术，在鼠垂小鼠脑垂体前叶中鉴定出了一种新的分泌多种激素的细胞类型，扩展了教科书的认知。

[6]Schutsky EK, DeNizio JE, Hu P, Liu MY, Nabel CS, Fabyanic EB, Hwang Y, Bushman FD, Wu H, Kohli RM (2018) Nondestructive, base-resolution sequencing of 5-hydroxymethylcytosine using a DNA deaminase. Nature Biotechnology 36: 1083.  5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）修饰在经神经早期发育和疾病中表观调控中发挥了重要的作用，研发了碱分率单碱基分辨率的5hmC测序技术。

[7](预印本) Fabyanic E*, Hu P*(共同第一), Qiu Q, Wang T, Berrios KN, Flournoy J, Connolly DR, Zhou Z, Kohil RM, Wu H (2021) Quantitative single cell 5hmC sequencing reveals non-canonical gene regulation by non-CG hydroxymethylation. Biorxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2021.03.23.434325.进一步在细水单细胞水平开发了碱分率单碱基分辨率的5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)测序技术。

[8]Hu P, Liu M, Liu Y, Wang J, Zhang D, Niu H, Jiang S, Wang J, Zhang D, Han B, Xu Q, Chen L (2016) Transcriptome comparison reveals a genetic network regulating the lower temperature limit in fish. Scientific Reports 6: 28952

[9]Zhou Y, Su Y, Li S, Kennedy BC, Zhang DY, Bond AM, Sun Y, Jacob F, Lu L, Hu P, Viaena A…, Ming G, Song H (2022). Molecular landscapes of human hippocampal immature neurons across lifespan. Nature, 2022, 607(7919): 527-533.

[10]Kwon DY, Xu B*, Hu P*, Zhao YT, Beagan JA, Nofziger JH, Cui Y, Xu B, Zaitseva D, Phillips-Cremins JE, Blendy JA, Wu H, Zhou Z (2022) Neuronal Yin Yang1 in the prefrontal cortex regulates transcriptional and behavioral responses to chronic stress in mice Nature Communications 13:55.

[11]Zhang D*, Yu M*, Hu P*(共同第一), Peng S, Liu Y, Li W, Wang C, He S, Zhai W, Xu Q, Chen L (2017) Genetic Adaptation of Schizothoracine Fish to the Phased Uplifting of the Qinghai–Tibetan Plateau. G3: Genes|Genomes|Genetics 7: 1267-1276.

[12]Zhang D, Hu P, Liu T, Wang J, Jiang S, Xu Q, Chen L (2018) GC bias lead to increased small amino acids and random coils of proteins in cold-water fishes. BMC Genomics 19: 315.

[13]Zhou T, Gui L, Liu M, Li W, Hu P, Duarte DFC, Niu H, Chen L (2019) Transcriptomic responses to low temperature stress in the Nile tilapia, Oreochromis niloticus. Fish & Shellfish Immunology 84: 1145-1156.

[14]Yu M, Zhang D, Hu P, Peng S, Li W, He S, Zhai W, Xu Q, Chen L (2017) Divergent adaptation to Qinghai-Tibetan Plateau implicated from transciptome study of Gymnocypris dobula and Schizothorax nukiangensis. Biochemical Systematics and Ecology 71: 97-105.

[15]Cao L, Huang Q, Wu Z, Cao D, Ma Z, Xu Q, Hu P, Fu Y, Shen Y, Chan J, Zhou C, Zhai W, Chen L (2016) Neofunctionalization of zona pellucida proteins enhances freeze-prevention in the eggs of Antarctic notothenioids. Nature Communications 7: 12987.

[16]Xu Q, Cai C, Hu X, Liu Y, Guo Y, Hu P, Chen Z, Peng S, Zhang D, Jiang S, Wu Z, Chan J, Chen L (2015) Evolutionary suppression of erythropoiesis via the modulation of TGF-β signalling in an Antarctic icefish. Molecular Ecology 24: 4664-4678.

[17]Lu Y, Li W, Li Y, Zhai W, Zhou X, …, Hu P, … Xu Q, Canario AVM, Chen L (2022) Population genomics of an icefish reveals mechanisms of glacier-driven adaptive radiation in Antarctic notothenioids. BMC Biology 20:231.

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